일루미나(Illumina, Inc.)(나스닥: ILMN)가 P3 대용량 플로우 셀(flow cell)을 상용화하여 염기서열 분석기기인 NextSeq™ 2000 시퀀싱 시스템의 적용 범위를 더욱 넓히고 있다.
P3 플로우 셀은 단 1회의 시퀀싱 런(run)에서 일루미나의 중간 용량 NextSeq 시퀀싱 포트폴리오보다 약 3배 많은 11억개의 리드(read)를 생성하여 시스템에서 실행 가능한 애플리케이션의 범위를 확대해 준다.
수잔 투시(Susan Tousi) 일루미나 CPO(Chief Product Officer, 최고 제품 책임자)는 “진보된 기술을 적정한 가격에 제공하는 NextSeq 2000용 P3 플로우 셀은 고객이 연구의 깊이와 폭을 더 확대하고 예산을 효율적으로 운영하여 더 깊은 통찰력을 얻을 수 있도록 해 준다”며 “이렇게 상용 제품 중 출시 시점의 데이터 품질이 가장 우수한 제품으로 고객의 신뢰를 더 높일 수 있게 되어 만족스럽다. 기기에는 수상 경력에 빛나는 일루미나의 통합형 인포매틱스 솔루션과 무손실 압축 소프트웨어도 내장되어 있어 고객은 끊김 없는 사용자 인터페이스를 통해 실행 가능한 정보를 추출할 수 있다”고 말했다.
리 머피(Lee Murphy) 에든버러 임상연구소(Edinburgh Clinical Research Facility) 제네틱스 코어(Genetics Core) 총괄은 “에든버러 대학교(University of Edinburgh)에서는 단일세포 RNA 시퀀싱 프로젝트를 비롯한 유전체학 연구 수행 시 종종 비용의 제약을 받고는 한다”며 “NextSeq 2000 시스템과 P3 키트로 데이터 출력량이 향상되어 우리 대학의 세계 정상급 연구진에게 제공하는 데이터의 가치를 높여주는 더욱더 복합적이고 유익한 연구가 가능해졌다”고 말했다.
노스캐롤라이나주 소재 후성유전학 기술 전문 기업인 에피사이퍼(EpiCypher)의 브라이언 벤터스(Bryan Venters) 유전체 기술 디렉터는 “이제 NextSeq 2000을 통해 시퀀싱을 외주로 진행하지 않고 회사 내에서 자체적으로 수행할 수 있게 됐다”며 “회사에서 개발하는 파이프라인을 직접 관리할 수 있게 되었다는 점에서 그 의미가 크다고 할 수 있다. 이번 P3 카트리지의 출시로 인해 시퀀싱 처리량이 더 높아지고 총 소요 시간도 더 단축될 것”이라고 내다봤다.
P3 플로우 셀은 총 네 가지의 사이클 옵션을 제공한다. 100 사이클, 200 사이클, 300 사이클 키트는 각각 런당 100 Gb, 200 Gb, 330 Gb를 생성할 수 있다. 이번에 일루미나에서 고객의 의견을 반영해 출시하는 50 사이클 키트는 감염병, small RNA 및 공간 전사체학(spatial transcriptomics) 연구에 응용이 가능하다. 또한 2021년 초에는 각 시퀀싱 런에서 60% 이상의 사용한 시약 카트리지를 쉽게 재활용할 수 있도록 해 주는 도구를 NextSeq1000 및 NextSeq 2000 플랫폼과 함께 제공할 예정이다.
그 밖에도 일루미나는 1회 런당 최대 4억 개의 리드를 시퀀싱할 수 있는 NextSeq 1000을 한층 더 저렴한 가격에 상용화한다고 발표했다. NextSeq 1000도 NextSeq 2000과 마찬가지로 신속한 2차 분석을 위한 온보드 인포매틱스를 지원하며 유전체 데이터 압축 기술로는 최초로 내장된 무손실 압축 기술을 클라우드 기반으로 제공한다. 두 시스템 모두 고객을 중심에 두고 설계했기 때문에 깊이 있고 실행 가능한 정보를 얻을 수 있는 방법을 명확히 제시할 뿐만 아니라 가장 직관적인 사용 경험도 제공한다.
마크 반 오엔(Mark Van Oene) 일루미나 CCO(Chief, Commercial Officer, 최고 상업 책임자)는 “NextSeq 1000과 NextSeq 2000은 규모의 경제를 실현하는 연구실이라면 시설의 규모와 상관없이 워크플로우를 간소화하고 더 자주, 더 많은 시퀀싱을 수행할 수 있도록 하기 위해 개발됐다”며 “일루미나는 런 비용의 절감을 통해 고객이 더 자유롭게 연구하고 유전체학의 발전을 이끌어 갈 수 있도록 지원하고 있다”고 밝혔다.
NextSeq 1000 및 NextSeq 2000과 P2 및 P3 플로우 셀은 현재 주문 가능하다.
